人类细胞外囊泡中miRNA表达的更新数据库
介绍
细胞外囊泡（Extracellular Vesicles, EVs）来源的miRNA作为细胞间通讯的关键介质，已在多种生理过程及疾病发生发展中被证实具有重要调控功能。然而，当前已建立的EV miRNA相关数据库普遍存在数据更新滞后、样本来源多样性有限以及整合分析工具匮乏等问题，大大限制了该领域的深入探索与应用转化。EVmiRNA2.0全面整合了来自45种来源、143类疾病的7,254个EVs小RNA测序样本。与上个版本EVmiRNA相比，EVmiRNA2.0主要有以下改进：（1）样本量从462个扩展到7,254个，数据量提升了15倍；（2）新增了在线差异表达分析功能，可根据project、EV subtype、sample source 或 disease stage/treatment 灵活筛选与比较；（3）增强的miRNA检索功能，可实现跨组织、跨体液与跨细胞类型的miRNA表达谱的检索，并融合功能注释、靶基因预测及药物交互信息等深度解析模块；（4）支持原始表达数据和分析结果的下载。凭借其丰富的数据和用户友好的网页界面，EVmiRNA2.0将为EV领域研究者探索EVs衍生的miRNA的表达和功能提供宝贵的资源。
浏览功能：
在浏览页面，我们提供基于多种来源（组织/体液/细胞/疾病）的直观数据探索界面。用户可通过点击图片查看特定疾病或组织的项目列表。
分析功能：
我们提供了数据库中所有数据集的完整列表。我们通过DESeq2工具在各个项目中进行差异分析。点击感兴趣的项目即可执行分析。
查找功能：
用户可搜索特定miRNA以查看其基本信息、在不同来源（组织、体液、细胞）中的表达水平、相关功能、靶基因、TCGA数据库中病例样本与正常样本的平均表达差异，以及关联药物。所有相关数据均提供下载选项。
参考文献
Xie GY, Song D, Luo T, Liao Y, Guo AY, Lei Q. EVmiRNA2.0: an updated database for miRNA expression in comprehensive human extracellular vesicles. Nucleic Acids Res. 2025 Oct 28:gkaf1054. doi: 10.1093/nar/gkaf1054. Epub ahead of print. PMID: 41157914.