数据资源一览
一、专病库数据
1.精神类疾病专病数据
合作临床科室:心理卫生中心
涉及人数:45720余名患者约3亿4183万条信息
数据来源:HIS+LIS+脑电+影像(报告),包括人口统计学信息、暴露/危险因素临床症状、患者住院记录、出院诊断、住院体格检查、住院检验、住院诊疗计划等信息。包含抑郁症,双向情感障碍,精神分裂症患者数据。
涉及年份:2008.12-2021.7
是否整理:已完成
2.食管癌专病数据
合作临床科室:胸外科;
涉及人数:12533例
数据来源:HIS/LIS数据,包括手术、入院、住院、出院、再住院、转科、诊断、随访、检验(心动超声、影像、病理、生化等)、基因等数据类型。
涉及年份:2008-2022
是否整理:已完成所有表的数据清洗
3.乳腺癌专病数据
合作临床科室:乳腺疾病中心、超声医学科;
涉及人数:7730人,结构化电子病历数据 8.2G、影像数据67G
数据来源:HIS+LIS+超声(报告及影像)+患者随访数据,
涉及年份:2009-2021
已整理:已完成清洗标化/完成影像数据的标注/已完成人口统计学信息清洗标化。
4.癫痫专病数据
合作临床科室:神经内科
涉及人数:1995人次
涉及年份:2020年7-2021年2月
数据来源:视频脑电系统
是否整理:已完成全部人次脑电数据标注
5.慢性肾脏病专病数据
合作临床科室:肾脏内科
涉及人数:10471人
涉及年份:2008-2022
数据来源:涵盖病案首页、就诊记录、诊断、检查检验、手术记录、病理报告等所有院内就诊信息,完成数据ETL标准化处理及文本报告NLP结构化。
是否整理:已完成
6.ICU专病数据
合作临床科室:重症医学科
涉及人数:14733名患者的27578次住院记录
涉及年份:2021.1-2022.10
数据来源:院内信息系统,人口统计学信息、就诊记录、诊断、检验明细、检查结论、护理病历、重症、病案首页、手术记录、转科记录、手术记录列、手术记录行、设备信息、入院24小时内相关检验结果、入ICU24小时内相关检验结果等信息;其中13673脓毒症患者用药,检验,转科记录已结构化。
7.风湿专病数据
合作临床科室:风湿免疫科
涉及人数:7135
涉及年份:2010.11-2020.10
数据来源:HIS,LIS,PACS,包括检验数据362万条,影像报告数据116万条
二、项目数据
1.糖尿病造影剂数据
合作临床科室:内分泌代谢科
涉及人数:5985人
涉及年份:2010-2020
数据来源:院内HIS、LIS
是否整理:已完成
2.食管癌CT影像数据
合作临床科室:胸外科;
涉及人数:500例;
数据来源:CT检查结果;
数据格式:dicom/png;
是否整理:已经完成500例患者食管区域全标注
3.骨显像数据
合作临床科室:核医学科
涉及人数:43027人
涉及年份:2018-2021
数据来源:骨显像数据1.6G
是否整理:完成清洗、脱敏及标注
4.肝细胞癌/结直肠癌数据
合作临床科室:肿瘤中心-腹部肿瘤病房
涉及人数:200+人
涉及年份:肝细胞癌2020年-2022年,结直肠癌2018年-2021年
数据来源:HIS+LIS+病理,后续陆续有测序数据
是否整理:已完成全部数据清洗标化
5.经导管主动脉瓣置换术(TAVR)患者数据
合作临床科室:心脏大血管外科
涉及人数:约2000人次
涉及年份:2000-2022
数据来源:HIS+LIS
是否整理:已完成全部清洗标化
6.老年死亡患者数据
合作临床科室:老年医学中心
涉及人数:1,801人/1,801人次
涉及年份:2011-2020
数据来源:HIS/LIS+检验检测+护理记录
是否整理:已完成全部清洗标化/已完成人口统计学信息清洗标化
7.高血压数据
涉及人数:21万人/33万人次/33万条住院记录
涉及年份:2009-2019
数据来源:HIS/LIS
是否整理:已完成部分清洗标化/已完成部分人口统计学信息清洗标化
8.包虫队列数据
合作科室:普外科-肝脏外科病房,生物医学大数据研究院
涉及人数:500
涉及年份:2020.7-至今
数据来源:调查问卷,血样的流行病学调查信息以及测序信息
是否整理:采集的为结构化数据
9.高尿酸小鼠RNA-seq + ChIP-seq数据
合作临床科室:肾脏内科
涉及数量:42小鼠/12RNA-seq样本/30小鼠ChIP-seq样本
数据来源:肾脏组织
10.COPD患者扩增子数据
合作临床科室:中西医结合中心
涉及数量:187人/187样本(自测)+2263人/2263样本(来源于NCBI的16s数据,并做了meta分析)
数据来源:唾液
11.食管癌患者RNA-seq数据
合作临床科室:胸外科
涉及数量:63人/127样本(自测)+136人/247样本(来源于NCBI的RNAseq,并做了meta分析)
数据来源:食管组织
12.小鼠颞下颌关节盘空间转录组数据
合作临床科室:华西口腔医院/正颌及关节外科
涉及数量:10小鼠,99GB
数据描述:下颌关节盘测序,不同年龄状态小鼠在不同天数时小鼠关节盘单细胞空间转录组
13.手臂肌电数据
合作科室:老年医学研究中心
涉及数量:手部肌电5人,前臂和腕部43人,共44GB
数据描述:5个受试者的手部运动的肌电信号和手指关节角度信号的数据;前臂/腕部的表面肌电信号43人,均为正常人。
14.肝硬化门静脉高压患者CT检查
合作临床科室:普外科-血管外科病房
时间范围:2019.1-2022.12
数据描述:122例肝硬化患者CT影像,共120GB
研究病种:肝硬化
15.糖尿病诊疗数据
合作临床科室:内分泌代谢科
时间范围:2010.5-2018.12
涉及人数:8W人
数据来源:HIS,LIS;包括括检验4900W条
16.近红外脑功能成像
合作临床科室:心理卫生中心
涉及人数:102人
研究病种:精神分裂症阴性患者
数据来源:近红外脑功能成像,及人口统计学信息
数据模态:结构化表格及半结构化脑功能成像数据
17.门诊数据
涉及人数:310W人 1100W条
时间范围:2021-2023
数据来源:HIS就诊数据,主要有就诊开始结束实际、预约信息、人口学信息
是否整理:已结构化
18.肾细胞癌组学数据
合作临床科室:泌尿外科
涉及人数:5人
研究病种:延胡索酸水合酶缺陷性肾细胞癌
数据来源:院内FHRCC患者手术标本,单细胞转录组测序
19.肝纤维化的机制研究
合作科室:消化疾病研究室
研究病种:肝硬化
涉及人数:30人
数据来源:基因测序
20.体检人群lis数据
合作临床科室:实验医学科
涉及人数:253万人次
时间范围:2014-2024
数据来源:HIS体检人群检验数据
是否整理:已结构化
21.胰腺炎
涉及人数:16541
时间范围:2010-2018
数据来源:HIS/LIS
是否整理:已结构化
三、医工交叉支持项目数据
1. 女性心因性癫痫数据
临床项目负责人:神经内科
患者数量:340例;
时间范围:2009-2020;
数据格式:csv/excel;
2. 老年康养行为数据
临床项目负责人:护理创新研究室;
患者数量:50例;
时间范围:2022;
数据格式:csv/excel;
3. 面部痤疮数据
临床项目负责人:皮肤性病科
数据量:18.5GB/1000例+;
数据格式:面部照相(jpg);
时间范围:2009-2020;
4. 肠镜
临床项目负责人:消化内科
数据量:32GB/17人;
时间范围:2022;
数据格式:jpg/avi;
5. 医疗设备物联网数据
临床项目负责人:放射科
数据量:6台;
时间范围:2222;
数据格式:json;
6. 肝细胞癌影像数据
临床项目负责人:放射科
数据量:186GB;
数据格式:dicom/nii;
患者数量:201例;
7. 肝细胞癌病理数据
临床项目负责人:器官移植研究所
患者数量:930例
数据量:10TB;
时间范围:2009-2019
数据类型:病理扫描数据
数据格式:滨松NanoZoomer数字病理切片扫描仪(NDP)扫描格式
8. 消化系统肿瘤
临床项目负责人:肿瘤中心
患者数量:1.3万例;
时间范围:2009-2022;
数据格式:csv/excel;
9. 核抗体荧光图像
临床项目负责人:互联网医院管理办公室
数据量:130张;
时间范围:2009-2022;
数据格式:jpg;
10. 腹主动脉瘤数据
临床项目负责人:普外科-血管外科病房
患者数量:170例;
时间范围:2009-2020;
数据格式:dicom
数据量:159GB
11.创伤后应激障碍(PTSD)患者数据
临床项目负责人:心理卫生中心
患者数量:151例;
数据量:23.5GB;
时间范围:2009-2020;
数据格式:nii
数据类型:fMRI(头部3D)
12.白血病患者白细胞散点图
临床项目负责人:实验医学科(检验科)
患者数量:626;
数据量:1326张;
时间范围:2019.1-2022.2;
数据格式:png