人类衰老基因注释数据库AgeAnno

介绍

衰老是生物体功能特征的逐渐退化的必然过程。衰老过程中的机体功能恶化恶化可能是由分子和细胞水平的改变决定的，例如细胞间通讯失调、转录噪声增加和异常 mRNA 产生、局部染色质可及性改变和重塑以及端粒维护机制缺陷。 之前的研究结果表明，更好地了解衰老的分子和细胞机制有望导致更好地识别抗衰老和衰老相关疾病的靶点和策略。 目前现有的几个几个可用的老化数据库资源，如 Human Aging Genomic Resources、AgingAtlas、the Digital Aging Atlas、AGEMAP 和 Open Genes，这些数据库主要侧重于提供整合多组学数据集和收集衰老候选基因的资源。 目前，对这些衰老相关基因的潜在功能和机制，如调控机制、基因相互作用和局部可及性等仍缺乏认识。 此外，全局和组织/细胞类型特异性衰老标记物可能有助于理解异质性衰老过程和设计有针对性的抗衰老疗法。 为此，我们构建了 AgeAnno，一个单细胞分辨率下的人类衰老基因注释数据库，旨在通过使用单细胞 RNA 和 ATAC 测序数据对衰老相关基因的功能进行全面系统的注释。

分析功能

1. 在页面顶端栏有Home 页面，搜索（包含在不同分析功能中搜索）页面，下载分析结果与数据页面，数据库统计页面，帮助页面与联系我们页面。
2. 首页为数据库概述，简要介绍了数据库的目的，内容，使用的数据等方面。
3. 快速搜索：允许用户选择器官后，输入感兴趣的基因，或仅选择感兴趣的器官，得到这个器官内所有衰老相关基因列表。 在分析模块中，包含了数据库所具备的所有分析功能与结果，用户可根据感兴趣的分析功能进行查看，并点击搜索得到相应结果

链接功能

在数据库中，我们手动搜索了目前为止衰老领域相关的计算方法和工具，包括12种衰老时钟的计算方法，1种衰老相关药物预测方法，2种脑年龄计算方法和1种生物信息学工具箱。用户可通过此功能进行查看。

下载功能

我们将所有的分析结果，数据库所用的处理后数据都放在了github项目下，用户可在此功能中浏览下载文件数据的基本结构，并可点击链接跳转github进行下载。

统计功能

在统计功能中展示了本数据库所包含的统计信息，例如包含的器官个数，样本个数，细胞个数，衰老相关的差异基因个数，转录因子个数等等。

访问地址

访问地址1:https://relab.xidian.edu.cn/AgeAnno/#/
访问地址1:https://github.com/vikkihuangkexin/AgeAnno