辅助piRNA功能分析的数据库
介绍
Piwi-interacting RNA是一种具有多种功能的小型非编码RNA。piRBase是一个手动管理的资源，专注于辅助piRNA功能分析。piRBase v3.0版本致力于提供更全面的piRNA相关信息。最新发布的版本涵盖了1.81亿个独特的piRNA序列，包括44个物种的440个数据集。更多与疾病相关的piRNA和piRNA靶标已被收集和显示。pirna和靶标之间的调控关系已经被可视化。最新版本除了重用和扩展了上一版本的内容外，还增加了新的内容，包括金标准piRNA集、piRNA集群、piRNA变体、剪接连接piRNA和piRNA表达数据。此外，整个网页界面已经重新设计，为用户提供更好的体验。piRBase v3.0版本可以在http://bigdata.ibp.ac.cn/piRBase上免费访问、浏览、搜索和下载
搜索功能
- Search piRNAs by piRBase id
指定搜索范围(在piRBase中的所有piRNA中搜索或只在金标准piRNA集中搜索)，输入一个piRNA id或多个piRNA id的逗号分隔列表，然后单击“搜索”按钮得到结果。
本页提供了在指定搜索范围内找到的piRNA项目的摘要。
单击piRNA id查看详细信息。
- Search piRNAs by functional information
例如，用户可以通过输入生物体和重复序列类型来搜索重复序列衍生的piRNAs。
浏览功能
指定一个生物体，然后单击“选择”浏览该生物体的所有pirna。
在填写旁边的文本框后，点击“显示”按钮可更改每页的条目数，在输入页码后，点击“页”按钮可跳转到某一页。此外，用户可以点击“下载”下载.gz格式的数据。
下载功能
在下载页面，用户可以下载.fasta或.bed格式的piRNA数据。例如，用户可以点击“aca.fa.gz”下载piRNA fasta文件For Sea hare(aca)。
访问地址
访问地址:http://bigdata.ibp.ac.cn/piRBase/about.php?